Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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