Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB9P17482 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms