Protein–RNA interactions for Protein: P17213

BPI, Bactericidal permeability-increasing protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIP17213 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIP17213 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIP17213 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIP17213 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIP17213 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIP17213 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPIP17213 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPIP17213 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIP17213 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIP17213 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIP17213 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIP17213 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIP17213 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIP17213 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIP17213 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIP17213 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIP17213 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIP17213 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIP17213 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIP17213 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIP17213 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIP17213 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPIP17213 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIP17213 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIP17213 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIP17213 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIP17213 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIP17213 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIP17213 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIP17213 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIP17213 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms