Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms