Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 GPALPP1-203ENST00000379151 1393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PYGBP11216 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 AP003716.1-203ENST00000533670 613 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 GCNT7-202ENST00000617620 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PYGBP11216 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 ZNF626-201ENST00000291750 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PYGBP11216 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms