Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYBBP04839 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYBBP04839 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYBBP04839 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYBBP04839 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms