Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1RP00736 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1RP00736 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1RP00736 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms