Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4FO95754 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms