Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITM2AO43736 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms