Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

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Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COCHO43405 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COCHO43405 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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COCHO43405 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COCHO43405 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COCHO43405 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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