Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSI1O43347 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSI1O43347 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSI1O43347 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSI1O43347 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSI1O43347 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSI1O43347 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSI1O43347 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSI1O43347 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSI1O43347 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms