Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS4O43181 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms