Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLGNO14967 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms