Protein–RNA interactions for Protein: O14965

AURKA, Aurora kinase A, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKAO14965 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AURKAO14965 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AURKAO14965 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AURKAO14965 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AURKAO14965 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AURKAO14965 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AURKAO14965 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AURKAO14965 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
AURKAO14965 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AURKAO14965 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AURKAO14965 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AURKAO14965 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AURKAO14965 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AURKAO14965 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AURKAO14965 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AURKAO14965 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AURKAO14965 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AURKAO14965 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AURKAO14965 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AURKAO14965 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms