Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms