Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM1B2RUZ4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms