Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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