Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA6L9A6NEM1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms