Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms