Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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ARL2-SNX15V9GYD0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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