Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms