Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED16Q9Y2X0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms