Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms