Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI30

TRMT112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT112Q9UI30 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRMT112Q9UI30 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms