Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CTSFQ9UBX1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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