Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms