Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPS29Q9UBQ0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms