Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms