Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms