Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.6 ms