Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms