Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC4A5Q9BY07 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms