Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms