Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms