Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSPG4P5Q96PW8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSPG4P5Q96PW8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSPG4P5Q96PW8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSPG4P5Q96PW8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSPG4P5Q96PW8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSPG4P5Q96PW8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSPG4P5Q96PW8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSPG4P5Q96PW8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSPG4P5Q96PW8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms