Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf49Q96NF6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms