Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF21BQ96EK2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms