Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPRY1Q96DX4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPRY1Q96DX4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms