Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HGDQ93099 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms