Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EDAQ92838 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms