Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TOPBP1Q92547 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms