Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD13Q8WZ19 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD13Q8WZ19 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms