Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms