Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL2Q8NHH9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms