Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE22Q8NFJ8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms