Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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