Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms