Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms