Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms