Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS8Q8N3P4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms